یکی دیگر از مکان های بسیار دیدنی در تور استانبول موزه باستان شناسی استانبول است. در این موزه میلیون ها شیء عتیقه نگهداری می شود. خود موزه در سال 1891 باز شد و در واقع سه ساختمان جداگانه است که شامل موزه شرق باستان می شود. این موزه در نزدیکی کاخ توپکاپی قرار دارد.
موزه باستان شناسی استانبول از سه موزه ی 1- باستان شناسی (ساختمان اصلی) 2- موزه هنرهای اسلامی و ترکی 3-موزه شرق باستان تشکیل شده است. در موزه باستان شناسی استانبول بیش از یک میلیون قطعه ی با ارزش نگهداری می شود که تاریخ و تمدن دوره های مختلف جهان را در خود جای داده اند. موزه باستان شناسی استانبول در سال 1811 میلادی به وسیله ی عثمان حمدی بی بنا نهاده شد. موزه ی باستان شناسی استانبول در سال 1908 به سبک بازسازی شد.
الهام بخش ترین نمای این ساختمان، تابوت زنان عزادار و تابوت اسکندر بوده که هر دو از برجسته ترین آثاری هستند که دورن موزه نگهداری می شوند. همچنین این آثار به دلیل سبک نئو کلاسیک شان از شهرت بسیاری برخوردارند.
سومین ساختمان مجموعه موزه، عمارت کاشی کاری فوق العاده سینیلی کوشک(Cinili Kösk) است که یکی از قدیمی ترین ساختمان های باقی مانده از دوران عثمانی در استانبول است. با توجه به زمان ساخت یعنی سال ۱۴۷۲، تاثیر هنر فارسی در معماری آن کاملا مشهود است.
موزه باستان شناسی استانبول در بخش اروپایی استانبول و در همسایگی کاخ توپکاپی و پارک گلخانه واقع شده است. موزه باستان شناسی استانبول در محله سلطان احمد قرار دارد، که توسط موزه ها و مکان های تاریخی و هتل ها احاطه شده است.
علاوه بر بخش صیدون، این مجموعه شامل یافته های سراسر امپراطوری عثمانی نیز می شود. از نمونه های بسیار زیبا می توان به تابوت های ساتراپ (Satrap) قرن پنج قبل از میلاد، تابوت لیسیان(Lycian) چهارصد سال قبل از میلاد و تابوت سیدامارا(Sidamara) متعلق به کنیا (Konya ) در قرن سوم اشاره کرد. حتما از موزه دیدن نمایید و خاطره بسیار زیبا از تور استانبول برای خود به یادگار بیاورید.